一、专项资金实行“专人管理、专户储存、专账核算、专项使用”。

二、资金的拨付本着专款专用的原则，严格执行项目资金批准的使用计划和项目批复内容，不准擅自调项、扩项、缩项，更不准拆借、挪用、挤占和随意扣压；资金拨付动向，按不同专项资金的要求执行，不准任意改变；特殊情况，必须请示。

三、严格专项资金初审、审核、审核制度，不准缺项和越程序办理手续，各类专项资金审批程序，以该专项资金审批表所列内容和文件要求为准。

四、专项资金报账拨付要附真实、有效、合法的凭证。

五、加强审计监督，实行单项工程决算审计，整体项目验收审计，年度资金收支审计。

六、对专项资金要定期或不定期进行督查，确保项目资金专款专用，要全程参与项目验收和采购项目接交。

专项资金按照下列原则管理和使用：

（一）统筹规划。省级财政部门应当会同有关部门和单位，结合本省（自治区、直辖市、计划单列市、新疆生产建设兵团，下同）经济社会发展规划、科技发展实际需求和现有科技资源布局，编制本省科技基础条件建设五年规划，并在规划内确定分年度支持重点。

（二）突出重点。专项资金应当集中财力办大事，重点支持能够提升本地区、单位科技创新能力或科学普及水平的项目。

（三）倾斜扶持。专项资金对中西部地区给予适当倾斜扶持。

（四）专款专用。专项资金应当按照规定用途专款专用，不得用于本办法规定范围以外的项目，不得抵顶单位行政、事业经费。各级科技、财政部门和有关单位不得截留、挪用和挤占。